Американские ученые из штата Мичиган полагают, что в качестве главной причины отравления вод Мирового океана ртутью являются бактерии.
Американским ученым удалось выяснить, как лягушкам удается продолжать жить даже после глубокой заморозки.
Биологи уже давно считают, что продолжительность жизни животного определяется очень просто: чем оно больше, тем дольше живет.
Ensembl (http://www.ensembl.org/) [54], гены со значением гипергеометрического скора более 3.0 считались значимо дифференциально экспрессирующимися. Анализ представленности Gene Ontology (http://www.geneontology.org/) [55] категорий в списке отобранных генов осуществлялся с помощью гипергеометрического теста. Категории с p-value меньше чем 0.01 считались значимо перепредставленными. Десять наиболее представленных категорий приведены в таблице 2
.
В список выявленных дифференциально экспрессирующихся генов входят ранее известные участники гомеостаза железа, такие как, TfR1, Dmt1, цитохром b редуктаза, ферропортин, Hfe, Cp, Hp, Slc11a2, Steap3, Slc25a37 (категории "iron ion transport", "response to iron ion" и " cellular iron ion homeostasis").
А также группы генов ранее не замеченных в регуляции гомеостаза железа, из которых следует отметить группу генов, участвующих в гомеостазе ионов меди, представленные в таблице 3
и участники липидного гомеостаза таблица 4
.
Таблица 2.
Список категорий Gene Ontology, наиболее представленных среди генов с измененной экспрессией.
Gene Ontology категория |
p-value |
cholesterol metabolic process |
4,54E-09 |
angiogenesis |
2,73E-05 |
lipid binding |
2,95E-05 |
electron carrier activity |
3,60E-05 |
lipid transport |
6,20E-05 |
phospholipid metabolic process |
1,30E-03 |
cellular copper ion homeostasis |
1,80E-03 |
cellular iron ion homeostasis |
2,40E-03 |
responce to iron ion |
2,70E-03 |
iron ion transport |
3,30E-03 |
Таблица 3.
Гены, регулирующие гомеостаз меди, экспрессия которых значимо коррелирует с уровнем железа в ткани.
Ген |
Название |
Mt1 |
metallothionein 1 |
Mt2 |
metallothionein 2 |
Atp7a |
ATPase, Cu++ transporting, alpha polypeptide |
App |
amyloid beta (A4) precursor protein |
Prnp |
prion protein |
Таблица 4.
Гены, регулирующие гомеостаз липидов, экспрессия которых значимо коррелирует с уровнем железа ткани
Ген |
Название |
Apol7a |
apolipoprotein L 7a |
Apoa5 |
apolipoprotein A-V |
Apoc3 |
apolipoprotein C-III |
Apoa1 |
apolipoprotein A-I |
Fabp4 |
fatty acid binding protein 4 |
Plcg1 |
phospholipase C, gamma 1 |
Acsl1 |
acyl-CoA synthetase long-chain family member 1 |
Srd5a1 |
steroid 5 alpha-reductase 1 |
Ppara |
peroxisome proliferator-activated receptor alpha |
Cyp39a1 |
cytochrome P450, family 39, subfamily A, polypeptide 1 |
Slc27a2 |
solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 2 |
Pnpla8 |
patatin-like phospholipase domain containing 8 |
Pemt |
phosphatidylethanolamine N-methyltransferase |
ALOX15 |
arachidonate 15-lipoxygenase |
GPAM |
glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial |
Смотрите также
Культивирование, выделение, очистка и идентификация продуцентов биомассы
Введение
Биотехнология
- стремительно развивающаяся и интегрирующая наука, пронизывающая все
биологические науки и направления исследований. Современная биотехнология - это
междисцип ...
Мембранный потенциал
Введение
Современная
наука развивается стремительно, и чем больше мы движемся по пути прогресса, тем
больше убеждаемся в том, что для решения каких-либо научных задач необходимо
объе ...
Ботанические сады Украины
Введение
В своем реферате я рассмотрю один из главных туристических ресурсов,
который всегда пользовался большой популярностью среди туристов. Это
ботанический сад. Только здесь можно ...